Уж очень диковинное что-то у Вас получилось. Более традиционные методы такие. Если база файловая, то сделайте на убунте расшаренную папку, положите туда базу, у пользователей в обычном виндовом клиенте 1С пропишите путь к этой базе и работайте. Ещё лучше её в SQL вариант перевести, особенно если пользователей много и работа интенсивная - на убунту ставите сервер б/д и сервер 1С, у пользователей клиент 1С (инструкций по установке-настройке в интернете полно). Но это будет дополнительных денег стоить (лицензия на сервер 1С-Предприятия).