в node.js есть то чего нет в PHP
Все там есть, просто чуть дольше и меньше решений адаптированных под асинхронную работу. Тот же reactphp может использовать libuv + libev что по сути основа ноды.
Но Python для чего, он ведь мало отличается от PHP по функционалу?
Отличается и сильно, например на нем очень удобно писать скрипты для провиженинга, автоматизация действий, утилитки и т.д. Ну и да, он поуниверсальнее пыха будет.
Так же, если разработчик освоил какой-то еще язык хотя бы на базовом уровне, например познакомился с чудестным миром python, это будет влиять и на то как он пишет код. Скажем в python/node.js более сильно развита парадигма функционального программирования, что в PHP мало кто практикует (хотя с каждым днем все больше).