Мне одному кажется, что куда разумнее будет перейти с файловой 1С на MSSQL и самой простой репликацией, передавать определенные поля таблицы "заказы покупателей". А дальше в гугле "Репликация MSSQL > MySQL".
Я так понял, они собрались передавать вам полный файл обмена. Сколько у них народа работает в 1С и на сколько большая у них, а так же как много информации туда забиваются у вас не указано. Но тут есть одна проблема. Эти обмены довольно большие (у нас не сжатая xml весит 700метров в среднем), если ИБ используется активно и парсить их достаточно долго и геморойно, особенность если еще и сжимают их. Данные же будут ну раз в сутки передавать, ну два максимум. Так же в них будет еще хренова туча лишней информации.
От сюда выводы я вижу такие:
А - продолжать в том же духе и ваш сервер будет довольно долго парсить эти xmlы и информация будет обновляться редко
Б - вынудить их перейти на MSSQL/PostgreSQL
В - Что бы их 1С программист написал индивидуальный обмен, который будет выгружать хотя бы в тот же txt/xml заказы покупателей с нужными вам полями.