Все более-менее известные антивирусные решения имеют централизованный сервер/консоль управления и поддерживают серверные и клиентские ОС.
Наиболее распространенные решения, которые я видел в организациях, были Kaspersky, Symantec, McAfee, TrendMicro. По части управления у всех есть преимущества и «тараканы», но больше всего понравился Kaspersky и Symantec (с ним больше работал).
Microsoft Forefront Endpoint Protection неплох, но для централизованного развертывания потребуется выполнить очень много «дополнительных» работ (требуется полноценный SQL Server с Reporting, WSUS для обновления и SCCM для централизованного управления).
В маленьких организациях также встречал антивирусы от Dr.Web (правда с централизованной консолью работал более 2-х лет назад, но на тот момент она была самой ужасной и кривой из тех, что доводилось видеть), Eset.
Я бы порекомендовал попробовать поставить триальные версии от разных производителей и выбрать то, что кажется вам наиболее функциональным/удобным.