Да, нужно настроить xephyr сервер +X сервер, запускаемый в окне на другом x-сервер (даже если он заливается wayland). Подробно расписать настройки не могу, там нужно будет ещё расписать, какая клавиатура и мышь к какому серверу относится... И уже для этого x настраиваешь утилиту удаленного доступа, хоть по vnc, хоть по rdp.
Если у тебя не wayland (например xfce de) а сразу xserver и главное, на каждое рабочее место (монитор) своя видеокарта, то штатная утилита loginctl позволяет настроить несколько рабочих мест (термин multi seat), она консольная, но показывает список устройств и позволяет привязать по отдельности своему seat.
P.s. точно помню ibik aster, которые такие решения для windows сделали, выпустили свою по для linux, по уму это интерфейс к вышеописанному... Для windows было очень удобно.