Паять в комнате можно, но есть за тем же столом, где паяете, не стоит.
Главный риск это дым от флюса: он раздражает дыхательные пути, поэтому нужна вентиляция и не стоит дышать прямо над местом пайки. Свинец из припоя опаснее не через воздух, а через грязные руки и попадание в пищу.
Для любительской пайки несколько раз в неделю это обычно не является серьёзной проблемой, но лучше иметь отдельную зону для пайки.