Оба полезны, но всё же я бы их не сравнивал.
keys.so - для рунета, и это более сервис видимости по запросам и для работы с семантикой. Информацию по ссылочному они тоже предоставляют, но метрики оценки используют свои, базы недостаточно полные, да и с обновлениями там не то чтобы быстро. Из плюсов – доступность.
ahrefs – это как раз больше про ссылочное, притом для работы в бурже. Из минусов – ценник и блокировки для РФ. Есть смысл использовать соответствующие выгрузки из сторонних источников, когда это действительно нужно.