И в целевом каталоге не создаётся никаких файлов? А на другой машине? В линуксе? А по https получается сделать? Права конкретно на этот репозиторий все правильные есть? Администраторам гитлаба вопрос задавали? Возможно на сервере какие-нибудь логи стоит проверить (точно не скажу, т.к. в такую глубину гитлаба еще не забирался). Опять же - возможно какие-то проблемы на самом сервере.
Буквально в предпоследней версии Git (2.46 вроде) было что-то про сжатие пакетов для передачи на серверной стороне. Видел в списке изменений, но не вникал и не щупал. Чисто для инфы пишу.