Так и должно быть. Более того, так на большинстве ОС.
А вот .../www, например, будет владеть пользователь www-data. Когда установите, какой нибудь, Apache.
Особенность ubuntu, что логин рута, как с терминала так и по ssh по умолчанию запрещен. Поэтому установщик требует создать хотя бы одного пользователя.
То есть, сперва Вы логинитесь под обычным пользователем. А затем, делаете все с sudo. Ну или, если Вам нужно больше работать с сервисами, то сразу sudo su. Если не хочется набирать пароль укажите в sudoers выполнение без пароля для этого пользователя.