Вы уверены, что с флешки загрузились в режиме UEFI и в нем же поставили систему?
Если у вас стоит запрет на загрузку с внутреннего диска в режиме BIOS, но при этом разрешено грузить с внешних носителей - вы получаете запрещенный загрузчик.
И наоборот - если вы накатили UEFI и грузитесь в режиме BIOS, тоже без шансов.