Вы задаёте не тот вопрос. На Ваш вопрос ответ более чем очевиден - в файловой системе флешки есть сбой. Всё! Реально же интересовать здесь могут две вещи:
1) По каким причинам мог возникнуть этот сбой? Тут возможна масса причин. От "небезопасного" извлечения флешки до её необратимой неисправности. Вы лучше знаете, что предшествовало сбою.
2) Можно ли спасти информацию с флешки? Тут всё зависит от ценности информации и какие затраты по её спасению Вы можете себе позволить. И в результате либо плюнуть на нечитаемые файлы, либо по всей науке снять образ, работать с ним, обратиться к специалистам.
Точнее говоря, есть ещё и третий момент - что дальше делать с этой флешкой? А это зависит от предыдущих двух пунктов. Если всё ценное Вы с неё извлекли, то возможно достаточно сделать ей стандартную проверку диска или отформатировать. Если какие-то сбои повторяются - выкинуть.