Заливать ничего не надо, для работы с полигонами есть специальные библиотеки:
www.angusj.com/delphi/clipper.php
Для частного случая с окружностями, когда с контуром не нужны никакие манипуляции, можно простым перебором искать сегменты, которые находятся в какой-либо окружности, и не рисовать их.