Лаги бывают разные:
долго неиспользуемые окна долго разворачиваются (вместо окна черный прямоугольник);
до этого моментально открывавшиеся проги открываются очень долго;
все анимации начинают тормозить: например открываю много прог, потом жму Завершение работы, и кружочек состоящий из кружочков, сигнализирующий о проведении операций в Win8.1, конкретно притормаживает. (замирание анимаций также наблюдал в Ubuntu)
Проблема в RAM? memtest проходит нормально. Хотел взять у кого-то другую планку и попробовать с ней, но нет такой возможности.
Проблема в параллельном использовании SSD + HDD ?
В чем может быть проблема?
Один тормозной HDD может тормозить всю систему. Проверьте только с одним SSD.
Если в биосе установлен режим IDE то переключите его на AHCI.
Проверьте надежность соединения SATA шлейфов на обоих концах. Переключите на другое гнездо мат. платы.
Проверьте загрузку диска и процессора в диспетчере задач, возможно какой-то процесс съедает все ресурсы. Возможно, даже системный, если проблема в оборудовании.
Есть ещё предположение, что у вас не установлен драйвер видеокарты. С ним всегда интерфейс тормозит.
Возможно, есть вопросы к SSD - наблюдал подобное на A-data - все начинает заметно тормозить непонятно почему, если получится - обновить прошивку диска. Ещё - хорошее правило при разметке SSD оставлять немного неразмеченного места.