Настоятельно рекомендуется (исключит большую часть проблем) устанавливать каждую OS, извлекая второй диск, т.е. чтобы во время установки система не видела вторую ОС
Старые версии winxp/7 могли установить вторую ос на диск D (буквально диск D как системный), не уверен, исправили ли эту проблему в win10, и это порождало огромное количество проблем для программ, которые этого не ожидали, т.е. при загрузки второй установленной ос у тебя было видно первую ос на C а вторую (текущую) на D, некоторые программы при установке принудительно устанавливаются на C, соответственно затирая эту же установку (файлы common files, ориентированные на версию ОС)... шансы проблем не велики но они возможны (я встречал)
Если же во время установки виден только один диск, то он будет гарантированно диском С, даже если позже вставить второй диск, он станет D (т.е. какую бы ты ОС не запустил, другой диск будет D)