С разьема USB Вы максимум, что снимите — это 5V. А мотор вентилятора видеокарты, скорее всего, на 12V. Если подключить такой вентилятор на 12V к 5V, то он будет либо
слоупочить медленно вращаться, либо просто стоять и питаться током. Но если Вы — счастливый обладатель редкого вентилятора на 5V, то смотрите ток (на нем написано): он не должен превышать 200-250mA, т.к. максимум, отдаваемый USB портом — 500mA, и флешка с вентилятором вместе не должны превышать этот порог (иначе будет фейерверк). Для экспериметов предлагаю взять копеечный источник питания на 5V, чтобы ничего дорогого (южный мост) не спалить. Вот примитивнейшая схема, согласно которой Вы должны все соединить.