Собственно, вопрос в сабже.
Например прописав адрес сервера, с которого происходит отправка в spf или dkim.
Суть в том, чтобы для каждого пула php-fpm (несколько сайтов работают, каждый из под своего пула) прописать:
php_admin_value[sendmail_path] = "/usr/sbin/sendmail -t -i -f 'sales@my1_site.ru'"