Решение вопроса:
Использовать API 1С для обновления данных заказа с сайта в учетной системе 1С
При базовой интеграции Интернет-магазина с 1С по стандарту CommerceML невозможно обновлять данные заказов повторно из интернет-магазина, которые уже созданы в 1С.
---
Как формируется обмен между ИМ и 1С по стандарту CommerceML:
1) Создается заказ в ИМ и при обмене он создается в 1С
2) Вы можете изменять параметры, статусы созданного заказа в 1С и они могут передаваться в ИМ, то есть Вы уже осуществляете управление заказами через 1С, а не через ИМ.
При таком обмене, если Вы совершите изменение заказа в ИМ, такие изменения не передадутся в 1С, потому что при таком обмене не предусмотрены методы повторной загрузки обновленных данных заказа из ИМ.