На сколько мне известно - прямой возможности определить уникальность пользователя нет.
Можно попробовать сделать вывод на основе ОС пользователя и т.д (
https://developer.chrome.com/extensions/runtime#me...
Но это все хаки.
Наиболее адекватный вариант - использовать Google Analytics.
Также можно использовать OAuth или OpenID.
(см.
https://productforums.google.com/forum/#!topic/chr...
С известных мне способов этот самый надежный.
Хотя, может, за последнее время что-то новое появилось, поэтому буду следить за ответами в данном вопросе =).
Удачи в разработке расширения!