Такая библиотека только одна - pyrogram. Её авторы пытаются реализовать одинаковый интерфейс для двух разных видов API Телеграма. Если при инициализации бота передать токен - будет использоваться Bot API, если имя сессии - будет при первом запуске проведена авторизация в Телеграме, а потом будет всегда работать из-под пользователя при каждом запуске. Конечно, совсем без нюансов и различий нельзя, но в целом это работает.
Но даже с этой библиотекой придётся инициализировать двух разных ботов и организовывать между ними какое-то взаимодействие (что может вылиться в дополнительную не самую простую задачу). Например, боту требуется по запросу отправить большой файл, он из API userbot'а отправляет самому себе (обычному боту) файл, тот получает file_id и пересылает его конечному пользователю.
Поскольку ботов фактически будет всё равно два, то они могут использовать и разные библиотеки. Например, aiogram и telethon или telebot (AsyncTeleBot?) и pyrogram.
