Очевидно, что превышается допустимое время на установку библиотек. Происходит это из-за долгого времени поиска "совместимых" библиотек. По идее, должно помочь выполнить установку в два захода - сперва условную половину (главное, чтобы было чуть меньше, чем успело установиться до ошибки), после чего прогнать весь список (первая часть установиться из кешированых локальных версий, скачанных в первый раз, что займет куда меньше времени)