Ну у меня на серваке работает KVM и docker,.. проблем нет.
но у меня ресурсов достаточно, KVM всё не забирает
В проксмокс тоже можно так сделать, там же дебиан голый. Но наверно лучше виртуалку развернуть и засунутьв неё докер. Или лучше даже LXD контейнер