Наверное, вы минимизируете не приложение SubLime, а только одно из его окон. То же, проверил, происходит и с другими, например, с MongoDB Compass. Минимизируешь окно – остаётся заголовок приложения. Переключился в браузер. Переключился назад в Compass: заголовок есть, окна минимизированы, надо мышкой тыкать.
Выход 1. Минимизировать таки всё приложение: обычно это Cmd + H (от слова Hide). Тогда все его окна прячутся, а когда вернётесь, все снова вылезут.
Выход 2. Имхо удобно пользоваться несколькими десктопами: смахивать влево-вправо тремя пальцами (или Ctrl + стрелка). Тут браузер. На другом редактор кода во весь экран. На третьем тоже редактор, с другим проектом.