Если выберешь в панели управления win8.1 пункт обновление(UPDATE) или при новой установке ОС и следуя инструкциям завершишь ее, то файлы и настройки системы(почти все, уже существующие) будут мигрированы(сохранены).
А вот если выберешь Сброс(RESET), то будет сделана операция по сценарию завода...