Первое, нет такого жутко пинговать.
Второе, от mtu может напрямую зависеть потеря пакетов.
Третье базовый размер "ping" пакета очень маленький и на пакетах такого размера потеря может не выявляется, особенно это характерно для радио сред.
Четвертое, некоторые приложения это настолько не точное определение, что оно не позволяет делать хоть какие-то выводы, может у вас просто cpu загрузка уходит в 100%.
Пятое, потеря пакетов до разных узлов может быть разной.
Попробуйте в момент возникновения сетевых проблем использовать ping с пакетами большего размера, если это вообще сетевые проблемы, из вашего описания это не следует.