Вы можете сделать зависимость от основного скрипта с помощью
wp_add_inline_script()
add_action('wp_enqueue_scripts', function() {
wp_enqueue_script( 'my_scripts', get_stylesheet_directory_uri() .'/my_scripts.js' );
wp_add_inline_script( 'my_scripts', '$(\'.selectpicker\').selectpicker();' );
});
/* Получим в HTML коде
<script type='text/javascript' src='http://example.com/wp-content/themes/mytheme/my_scripts.js'></script>
<script type='text/javascript'>
$('.selectpicker').selectpicker();
</script>
*/