Если ваша теория про прерывание выключение приложениями верна, то
нечто подобное (в самом низу, остальные проверки целостности и прочие любимые бесплатной техподдержкой "решения" смело пропускайте) должно помочь:
Navigate to HKEY_CURRENT_USER\Control Panel\Desktop.
In the right pane, right click the empty space and choose New >DWORD Value.
Rename the newly created DWORD (REG_DWORD) as AutoEndTasks.
Double click on it and change its value 1
Должно закрывать все приложения не задавая вопросов.
Раньше применял подобные твики сразу после установки Windows, но последние года два меня эта проблема не беспокоила, поэтому забил. На практике
вроде как (раньше там не было таймаута, не знаю, как сейчас) приложения могут не дать ПК выключиться и остаться висеть на диалоге "This app is preventing shutdown", но чтобы
отменить выключение вообще - такого не видел.
Кроме того, странно выглядят снова
запускающиеся приложения из автозапуска: такое должно происходить только при повторном входе в систему, чего без участия пользователя происходить не должно в принципе, как мне кажется... Покопайтесь на всякий случай в планировщике событий, может причина такого странного поведения там найдется.
Если твик реестра не поможет, то можно копнуть глубже: там есть еще настройки вокруг этого диалога, включая как минимум таймаут.
