после того как сделали данную настройку(при подключении по RDP выбрали использовать сочетание клавишь на удаленном компьютере) сканер стал сканировать лучше, но в 1с он по прежнему сканировал с ошибкой. Т.е. он начал сканировать через раз. Как выяснилось он сканировал дата-матрикс(код маркировки) частями, сначала сканировал половину кода потом другую. Вот скриншот, последние сканированные коды


