Обе технологии спокойно живут вместе, и проживут еще очень долго.
Java платформа проверена годами - существует огромное количество проектов, которые работают лет по 10, и обслуживают миллионы запросов в день, прекрасная экосистема, множество фреймворков, огромное количество инструментов и утилит. ASP .NET - хорошая платформа, удобные визуальные редакторы, можно побаловаться новомодной функциональщиной и еще кучей синтаксического сахара.Никто вам не скажет что лучше, кроме вас самих.Выбирайте исходя из своих предпочтений.
