Какую выбрать программу для хранения точек на карте?

Только проект Google maps называется вроде.

В целом плюсую за этот вариант.

1) Карту локации можно в офлайн загонять на телефонах
2) Поддерживается большинством андроид/apple девайсов.
3) Можно создавать разные слои для точек. Посмотрите достопримечательности какого нибудь города в интернете.

С компа - синхронизация будет через аккаунт google.

Так же обратите внимание на OSM и Yandex(если СНГ).

Dmitry Bay,

Только проект Google maps называется вроде.

4) Десктопная программа разгоняет кулеры так, что комп начинает улетать в космос от 50+ точек :)

Михаил Р.,
https://www.google.com/maps/
А тут Google Maps.
Я не знаю точно чем они сейчас отличаются. Помню на SONY WAIO 2008 года у меня было отдельно приложение земли в 3д, выглядело потрясно.