SearchQuery для сохранения поискового запроса в таблице search_queries. То есть когда используется метод where('column_name', 'LIKE', $query) в моделях (Chapter, Section, ....), следом надо сохранить $query в БД и вот здесь я использую модель SearchQuery.
А что за команда это вообще "sudo apt-get install -f"? Один раз выполнил он что-то установил и удалил 2-3 программы (помню LightWorks из удаленных которое не имел отношения к процессу).