zanooda

container.innerHTML += "<br />";
Во время этого вызова происходит преобразование innerHTML в строку, конкатенация, удаление всех потомков узла container, анализ получившейся строки и создание новых элементов-потомков.
Так как все элементы узла container заменяются новыми, то слушатели, которые вы вешали на потомков узла до вызова, естественно, не сохраняются.
Можно заменить на:

var br = document.createElement('br');      
container.appendChild(br);

Потому что вы изменяете не исходный текст страницы, а уже сформированное DOM-дерево. При добавлении тэга <table> браузер встраивает его в дерево автоматически закрывая завершающим </table>. Соответственно, следующие добавления идут после узла table.

var grid = $("#grid");
var table = $('<table>'), tr, td;
grid.append(table);

for (var height = 0; height < 16; height++) {
      tr = $('<tr>');
      for (var width = 0; width < 10; width++) {
            tr.append('<td></td>');
      }
      table.append(tr);
}

но вариант со строками будет быстрее работать за счет единственного изменения DOM.

примерно так:

public class JobHost : IRegisteredObject
    {
        private readonly object _lock = new object();
        private bool _shuttingDown;

        public JobHost()
        {
            HostingEnvironment.RegisterObject(this);
        }

        public void Stop(bool immediate)
        {
            lock (_lock)
            {
                _shuttingDown = true;
            }
            HostingEnvironment.UnregisterObject(this);
        }

        public void DoWork(Action work)
        {
            lock (_lock)
            {
                if (_shuttingDown)
                {
                    return;
                }
                work();
            }
        }
    }

public static class MyHelper
    {
        private static readonly Timer _timer = new Timer(OnTimerElapsed);
        private static readonly JobHost _jobHost = new JobHost();

        public static void Start()
        {
            _timer.Change(TimeSpan.Zero, TimeSpan.FromHours(1));
        }

        public static void OnTimerElapsed(object sender)
        {
            _jobHost.DoWork(() =>
            {
                // action ...
            });
        }
    }

ну и в global.asax прописать:

public class Application : HttpApplication
    {
        protected void Application_Start()
        {
            // ....
            MyHelper.Start();
        }
    }

Не инстанс контекста, а не самой БД - разные вещи!
Используй dependencyInjection и переиспользуй инстанс контекста БД в каждом последующем контроллере, подойдет NInject.
Где хостится сервер? IIS? Katana? Если IIS, то стоит помнить про то, что пул может убиваться, соответственно объекты не вечные, в отличие от self-hosted.

Чтобы минимизировать нагрузку и не завязываться на БД стоит продумать кэш в оперативной памяти, продумать сценарии рефреша страницы и подгрузки недавней истории. И, конечно же, корректно использовать entity для чтения (Не трэкать всё подряд) и записи (вставка пачками - bulkinsert по таймеру, если требуется ну очень много вставок).