То что просит прислать курьерской службой — это нормально. Документы между юр лицами также часто отправляют через курьера, чтобы было наверняка и быстро.
Насчет смущаещего фактора «получение обратно» — вы можете поделиться своими опасениями с работодателем и попросить прислать вам сразу же сканы по электронной почте, а потом также отправить вам посредством курьерской службы.
Мое мнение — что опасаться нечего, но нужно общаться с работодателем и не бояться делиться с ним своими опасениями (касается различных ситуаций)