Контекст-процессоры глобальны. И нет ничего неправильного в том, что некоторые из подключенных процессоров не используются в тех или иных приложениях. Дефолтные контекст-процессоры ленивы (т.е. не будут производить никаких вычислений, пока явно не обратятся к той или иной переменной контекста). Если свои писать в том же lazy-стиле, не случится ничего страшного.
Если же очень-очень хочется отключить какой-то из контекст-процессоров в том или ином приложении, можно использовать threadlocals, чтобы пропатчить settings.TEMPLATE_CONTEXT_PROCESSORS для текущего запроса. Но это некрасиво и вообще костыль, нмвз.
