Считается ли это плохим тоном?
Да, как и все остальное, что усложняет работу с кодом
Создают ли эти повторения какие-либо осложнения при рендеринге/где-то там на низком уровне
не должны, но там на низком уровне, каждый браузер работает по своему и обобщать тут не будет правильным.
Вредно ли для мобилок большое кол-во media
Вредно? Типа, взрывается ли от этого аккумулятор? Нет. Если речь о мобильном браузере, то в чем тут отличие от десктопного?
Возможно ли на практическом примере ощутить вред и с какого момента он становится ощутим.
Проведи эксперимент. Сделай 2 html страницы, к каждый свой css подключи и замеряй разницу. Потом расскажешь. Не думаю, что кто-то чем-то подобным уже занимался. Будет кстати интересно результаты посмотреть.