я такое делаю яваскриптом обычно, как писал Дмитрий Кравченко, создали в css нужный класс, потом когда нужно, повесили его на элемент яваскриптом. хотя как говорил один умный дядька, лучше не комбиновать js и css-анимации, или все чисто на css, или все на js.
вы толком просто не объяснили что вам нужно, может покажете пример, и скажете как должно быть в итоге, может мы все не туда копаем