Телефон хоть показывает, что зарядка началась? Если да - не хватает мощности по причине особенностей материнки, настроек компонентов или плохого провода.
Не надо так делать: у вас будет скрутка из проводов, которая может прохудиться и фаза попадет на тушку. Купите нормальную разборную вилку и поставьте ее вместо старой.
Открываете распиновку ATX-разъема, ищете нужные контакты. Указанное питание там есть. Открываете распиновку на имеющиеся на плате разъемы, ищете там дежурку. А напряжения измеряются вольтметром.
Запись куда? В RAM (и какого типа?) или во Flash? А есть еще SPI, I2C и прочие микросхемы с ячейками. Можете взять даташит на любую Flash-ROM микросхему и там посмотреть, обычно это там раписано.
Скорее всего с другой стороны платы чип и это с шансами фильтрующий конденсатор по питанию, работать без него, я думаю, будет. А что там еще - другой вопрос...