Об этом я и говорил, если повторить один в один эти шаги начинает сыпаться куча подобного "requires a peer of webpack@^1.0.0 but none was installed." и т.д.
например я юзаю jquery и всякие плагины, underscore, backbone, etc. Все эти зависимости используються в 45 из 46 модулях. Проблема, что бы их можно было, например, раз в конфиге написать, а в define не писать их в массиве, например
reactMixin(Login.prototype, React.addons.LinkedStateMixin);