Если у вас iframe грузится с другого домена, то никак.
Либо применять API соц. сети, откуда LIKE кнопка.
Для ВКонтакте, это например observer и его события.
Может быть дело в том, что плагин инициализируется быстрее, чем загружаются картинки
Попробуйте скачать плагин imagesloaded и по событию done инициализировать isotope.
В curl пробовали опцию cookie jar file? Если кука устанавливается не только через js, но и через заголовки ответа, то она запихнется в этот массив, а опция follow location в curl позволит "обновить" страницу, отправив нужную куку на сервер. Всё это сработает только при условии, что функции js дублируются в заголовках сервера.