Уже 5 лет работают относительно крупные инет магазины на joomshopping. Проблем никаких. С помощью стандартных механизмов расширений можно самому дописывать все хотелки заказчика. Много что готового. Все задачи от сеошников тоже без проблем решаются.
На мой взгляд некий симбиоз между самописным решением и open source cms.