tarasyarema

Грузишься с загрузочного диска(или флешки) и доходишь до момента выбора диска. Выбираешь разделы и внизу жмёшь удалить все. А потом жмёшь(с диском без разделов) дальше. Винда сама все разметит

Лучше запиши установочный образ винды!

когда ставлю с флешки винду, всегда выбивает ошибку Boot error

Видимо, BIOS не видит устройства, с которого можно загрузиться. Либо вы флешку загрузочную неправильно записали, либо в BIOS настройка загрузки с флешки не включена или в неверном приоритете перед сломанным загрузчиком на жёстком диске.

знаю что на Линукс другая файловая ситема

Это вообще ни при чём.