Чтобы понять как все устроено - почитайте про логические элементы И, ИЛИ, НЕ. Посмотрите как они физически из транзисторов собираются (их схему).
А процессор состоит не просто из однородных транзисторов, а из транзисторов, объединённых в те самые И, ИЛИ, НЕ, триггер и т. д.
А уже из них собраны сумматоры, регистры, кеши, контроллеры шин и т.д. С их схемотехникой и принципами работы тоже можете ознакомиться. (это все ключевые слова для загугливания)
Если про ассемблер речь - так опять же возьмите любую книжку по ассемблер вашего компьютера (ассемблер у всех процессоров разные! Если процессоры не совместимы) и изучите её, вот и узнаете про ассемблер ;)
Удачи!