stavinsky

Для начала не понял зачем там Apache, прошу прощения за оффтоп. PHP можно запускать через тот же php-fpm, python через uwsgi.
Если по делу, то:
Докер, по мнению разработчиков в далекой бете, и они просят не использовать его на продакшне.
Chroot не дает нужного уровня безопасности.
Да и не понятно что от кого защишать для начала. Из докера и chroot я бы наверное посмотрел в сторону lxc и за одно поинтересовался работой selinux, может и его хватит.

Google Cloud?

Смею предположить что .{7} это 7 любых символов, не только цифр. может пойти в сторону \d{7} или не очень помню как это в nginx. Плюс может у Вас там есть другие параметры дальше?

Для начала нужно понимать какая связка.
судя по перечисленным командам — обычный LAMP?

Предлагаю тогда начать со списка подсистем которые вы хотели бы проверять.
например:
1. Дисковая подсистема.
2. Сервер БД
3. Сервер приложений
4. Фронтэнд сервер (кеширующий обратный прокси например)
5. Качество запросов в БД (последний по списку но первый по необходимости проверки пункт)

Далее понять где же затык и только тогда начать анализ.
А вообще у меня лежит черновик статьи на данную тему. Выложу через пару дней.