Битрикс проверяет дату запуска агента через $DB->IsDate() и если у сайта в региональных настройках выбран к примеру en, то при создании агента и указании русского формата даты, агенты создаваться не будут. Это как одна из возможных причин. А так можно вывести массив ошибок в CAllAgent::CheckFields().