Если так уж боитесь что-то глобальное перезаписать, в первую очередь, изучите какие есть глобальные объекты и переменные в браузере (window, document и т.д.), дальше, не плохо было бы вспомнить, что для всех id в dom браузер создает переменные с именами, равными этим id и ссылающихся на эти элементы.
А теперь, внутри вашего модуля называйте переменные как хотите, за рамки модуля это не выйдет: хотите с префиксом, хотите без.
Например так:
myModuleGlobal = {
DOMElements: [],
EventListeners: [],
variables: []
}