Советую
https://github.com/bcgit/bc-csharp
т.к. это порт, то все доки в java версии, но там есть почти всё что может понадобиться в криптографии + приятный бонус ввиде реализации TLS и DTLS. Будет работать на всех платформах от .NET 1.1 (включая моно).
Для кровавого энтерпрайза там есть сертификация криптолабами и FIPS совместимая версия.
