директория которая аттачится в контейнер это проcто директория на хосте
что есть какие то проблемы заарихивировать директорию ?
ну а если внутри лежит что то что проблемно реплицировать то докер тут ничего не облегчит
то что работает в фоновом режиме по определению не может взаимодействовать с вводом выводом (они у нее "закрыты"
пишите вторую программу только для ввода и взаймодействие между первой и второй через ipc
получить можно многое