1.
12 гбайт являются частью раздела, и после создания раздела в 100.000000.000 вы увидите мЕньшее свободное место.
Чтобы точно считать сколько вы сможете записать данных, надо понять разницу между гигабайт и гибибит.
Опять же, если это одним файлом - то да, почти 88 гб. Если много маленьких файлов - все меняется.
2. Нет, отдельно купленные диски показывают размер обычно в гибибиитах, и это вообще еще без файловой системы. Количество данных которые можно записать будет зависеть от разбивки по разделам (при покупке ноута с предустановленной системой, вполне может быть несколько скрытых разделов для "восстановления винды к заводским настройкам". И от файловой системы.
MFT есть только в NTFS, в других файловых системах есть аналог. например в FAT - File Allocation Table, в линуксах это iNodes и так далее.
У каждой файловой системы есть свои плюсы и минусы, и нет особого смысла выигрывать несколько гигабайт именно за счет файловой системы, тем более для домашнего использования.
Если проблемы с местом - лучше докупить диск побольше.
