Saboteur

а так?

for i in $MAIL_LIST_CMD
do
        echo "$i "
done

Сложный пример, лень читать столько текста.
Но как минимум, вы не экранируете кавычки вообще. Как я понял,шлете ${CONSUL_HCL_FILE_CONTEXT... как есть, без изменений, а внутри лежат обычные кавычки. Естественно echo с ними не подружится в таком виде.
Разберитесь с экранированием ваших шаблонов.
На крайняк можно вообще кодировать весь файл в base64, передавать как строку, а там декодировать ее в файл.

Ты разбиваешь сперва файл на блоки, затем действия выполняешь не с блоками а со строкам в блоках.
Зачем тогда делить на блоки? считывай сразу построчно и работай со строками.
Ну или делай, например, два цикла:

while true; do
  STR=""
  for a in 1 2 3 4;do
    read
    STR="$STR $REPLY"
    [[ -z "$REPLY" ]] && break 2
    done
  echo "[$STR]"
done < file.dat

result:
[ test1; test2; test3; test4;]
[ read1; read2; read3; read4;]

res=$(step 1) && echo $res && sleep 5 && res="$res $(step 2)" && echo $rest ...

Но это немного бред. Не пишите многострочник, просто напишите скрипт или функцию.

А так пробовали?

RESULT=$(megacmd sync /tmp/site/ mega:/backup/latest/ 2>&1)
echo "Exit code: $?"
echo "Result: $RESULT"

А почему бы не показать ошибку, или что собственно не так?
У меня, например, работает.
Правда я бы переделал в трех местах, например так

for i in 192.168.55.{100..104}; do ping -c1 $i>/dev/null && echo $i is up || echo $i is down; done

cmd_out=$($cmd 2>&1)

Это лишняя конструкция с перенаправлением, у вас и так stdout и stderr смотрят в одно место, нет смысла перенаправлять еще раз

cmd="ssh -f -N -M -S $sock_file -p $remote_port -D $local_port -i $key_file $user@$host"
cmd_out=$($cmd 2>&1)

В чем разница этого вашего присваивания с выполнением и просто выполнением? Ведь нет никакой разницы.

ssh -f -N -M -S $sock_file -p $remote_port -D $local_port -i $key_file $user@$host

Эта схема работает когда ошибки есть, но виснет при отсутствии ошибок на следующем:

Что значит виснет? Какой результат ожидается? в интерактивный шелл вы не хотите (-N). Если подключение не происходит, то вам надо смотреть логи sshd на удаленном сервере. Возможно его конфигурация не позволяет подобное подключение.

'select domain  from 'web_domain' where 'domain_id'=$ELEMENT;'

Так одинарные кавычки вы когда везде ставите, вас ничего не смущает?
Попробуйте так

"select domain  from 'web_domain' where 'domain_id'=$ELEMENT;"

Пишете скрипт, который выполняет функцию переноса, с описанием в лог файл
настраиваете в cron запуск вашего скрипта раз в 30 минут

Собственно проблема в том, что это не баш, а expect, о чем говорит "#!/usr/bin/expect".
То есть баш в парсинге вообще не участвует. Надо читать доку по expect, как он работает с кавычками и экранированием

p.s. Есть вариант, что проблема может быть связана с ESC последовательностях телнета, но в первую очередь почитайте справку expect-а, что у него за спец-символы есть.

1.
-P, --no-dereference
never follow symbolic links in SOURCE
возможно у вас встречаются символические ссылки в пути?

2. Что такое "применять аргументы" где именно добавляет знак вопроса?
Пример вывода консоли или результата приведите, не очень понятно что у вас не так

В bash вы можете запустить процесс в фоновом режиме и получить его процесс ID через переменную $!
В этой переменной хранится PID последнего дочернего процесса.
Потом можно убить этот процесс при помощи kill
типа так

#!/bin/bash

./other_script.sh &
OTHER_PID=$!
while blablabla; do sleep 1; done
kill $OTHERPID

sed и базовое владение регулярными выражениями - то, что вам нужно.
Изменить строку, добавить, удалить, прямо в файле.

Вывести filename на экран с внесенными изменениями
sed -r "нужные вам команды" <filename>

Собственно сохранить внесенные изменения в сам файл.
sed -ir "нужные вам команды" <filename>

Чаще всего sed используется с командой "s" (замена), например
sed -ir "s/ENV_VAR_1=.*/ENV_VAR_1=321/" dev.env

bash. В принципе можно еще уменьшить..

grep -Po "^define.*(name|surname|password|api)[', ]+\K[^']+" FILE.TXT|while read; do
  echo -n "$REPLY";
  count=$(($count+1))
  [ $count -gt 3 ]&&count=0&&echo ""||echo -n ";"
done
echo ""

if [[ $a -ge 10 -a $b -lt 15 ]]; then echo ""; fi
if [[ $a -ge 30 -a $b -lt 35 ]]; then echo ""; fi
if [[ $a -le 10 -a $b -gt 15 ]]; then echo ""; fi
if [[ $a -le 30 -a $b -gt 35 ]]; then echo ""; fi

Предполагаю, что ориентироваться лучше все-таки на заголовок, а не на пустую строку:
tac file | sed -n '1,/^HTTP\/2/p' | tac