Как правильно строится система построения разных противников?

Ну используйте наследование, и класс для каждого разного врага.

Может кто-то помочь в поиске онлайн курсов?

нечасто ИБшники мутят свое решение.
Если компания решила нанять ИБшника как отдельная позиция, а не чтобы сисадмин все подзакрутил, то обычно приобретается какое-то решение под ключ, а ИБшник следит за его интеграцией и впоследствии обслуживает.
В общем ИБ как позиция - зачастую это больше бумажки, процедуры, мониторинг и интеграция.

Можете поискать какое-нибудь ИБ решение и почитать его документацию.
Поискать позиции, почитать требования

Как правильно строится система построения разных противников?

Да делайте как вам удобнее.

Вообще такие параметры можно и во внешнее хранилище вынести (csv, база данных) и подгружать оттуда.

Сайты "головоломки"?

я там нашел ссылку на zloirock.ru/, тоже норм головоломка

При подключении по SSH постоянно запрашивается пароль, как исправить?

запустил ssh-keygen

Оно сгенерировало именно id_rsa? Предыдущий удалили?
Ну явно говорит что не находит соответствие публичного и приватного.
На удаленном сервере никто ничего не менял? Может там теперь не authorized_keys а authorized_keys2?
посмотрите логи на удаленном сервере при логине?

Почему завершается процесс Screen при завершении SSH сессии?

А вы уверены, что скрипт там точно работает?
потому что -S означает запустить сессию с указанным именем, а не запустить скрипт внутри скрина.

Как подключиться к SQLite3?

xtensp, что такое "явная загрузка библиотеки dll во время выполнения" ?
Вы же сейчас не выполняете, вы компилируете код. Ему нужна не .dll а .h

При подключении по SSH постоянно запрашивается пароль, как исправить?

Есть подозрение, что либо публичный ключ неверный, либо приватный повредился.
Попробуйте скопировать id_rsa в другой файл, сгенерировать новую пару ключей и закинуть новый публичный ключ.

Как подключиться к SQLite3?

Ну видимо вы не подключили sqlite библиотеку, не указали заголовочный файл, вот и неизвестно что такое sqlite3
что такое sqlite3_open_v2

и было бы неплохо проверять что вы пишете, потому что ничего не жирное

Как генерируется подпись?

base64 это просо кодирование (НЕ шифрование) какой-либо информации, чтобы она выглядела как текстовая строка.
В base64 формате часто хранятся разные данные.

Как выполнить действие в sqlite3, через некоторое время?

Djimbo, Бот это программа.
Откройте исходники, запрограммируйте.
Если вы не умеете программировать, то как вам тут что-то могут подсказать? С нуля рассказать как программируется никому неизвестная программа?

Как зная MIME types в php получить расширение файла?

Mime type не всегда связан с расширением файла, хотя для большинства можно предположить.

Делаете таблицу соответствий, для четко известных файлов можно прописать расширение:
https://developer.mozilla.org/en-US/docs/Web/HTTP/...

Как выполнить действие в sqlite3, через некоторое время?

Djimbo, никак, sqlite это не база данных.
Действие нужно выполнять в вашей программе (в боте)

Как выполнить действие в sqlite3, через некоторое время?

А кто его знает что у вас за телеграм бот.
В нем реализуйте паузу, чтобы он игнорировал все, пока идет "время".

Есть ли сервис по предварительному просмотру веб страниц?

ince, без GUI интерфейса. Запускается в командной строке, генерит графическое изображение не выдавая его на экран, а сразу его либо сохраняет в файл, либо можно его использовать типа
"зайти на сайт и кликнуть на такое - то поле в нем". То есть сохраняется работа с отрендеренной страничкой, но все управление в консоли, без вывода изображения куда-либо.

Есть ли сервис по предварительному просмотру веб страниц?

В консоли можно так - ставишь chrome и:

chrome --headless --screenshot=с:\2.png https://example.com
chrome --headless --disable-gpu --screenshot=low_resolution.png --window-size=1280,768 https://example.com

В ноде, можно посмотреть какие-то готовые библиотеки. В ноде не силен, но посмотри https://bitsofco.de/using-a-headless-browser-to-ca...

Как использовать глобальные переменные функции исполняемой в $()?

Написал выше код, который делает то, что вы хотите

Есть ли сервис по предварительному просмотру веб страниц?

он консольный, часто используется для автотестов.

Как использовать глобальные переменные функции исполняемой в $()?

все, что не local и так будет "глобальным" в баш, поэтому можно просто присвоить переменную внутри функции.
сравнивать числа нужно не через >< а через -ne, -eq, -gt и так далее, иначе вы сравниваете строки, а не числа

Как использовать глобальные переменные функции исполняемой в $()?

#!/bin/bash
function request {
  start=$(date +%s%N)
  response=$(curl -sm 5 $1)
  local code=$?
  end=$(date +%s%N)
  GLOBAL_VAR=$((($end - $start)/1000000))
  #echo "$response"
  return $code
}

request "http://google.com"
code=$?
echo "Time: $GLOBAL_VAR"
echo "Response: $response"
if [[ $code -ne 0 ]]; then
  echo "Error: $code"
fi