мне вот не до конца понятно, каким образом и куда у вас настроенна выгрузка архивов, на регистратор или отдельный компьютер/сервер?
если комп то при чем тут его файловая система, ведь если файлы пишутся и открываются, то проблема явно в другом месте
если на регистратор, то проблема скорее в софте, так как ivms 4200 коннектится напрмямую к видеорегистратору, и считывает архивы оттуда. и опять таки если на нем напрямую файлы открываются а через интерфейс программы нет, то вывод очевиден